桂林南药是一个拥有现代化的质量检验设备、高素质的质量管理团队、先进的质量管理方法和完善的质量管理体系的企业，所生产的全部剂型均已通过国家药品GMP认证，部分产品先后通过美国食品和药物管理局（FDA）、世界卫生组织（WHO）的审计和认证。2014年5月，成为了国家食品药品监督管理总局GMP检查员实训基地，将承担国家级药品GMP检查员的培训、考核工作。

企业的质量管理团队由质量保证部与质量控制部组成。质量保证部通过系统的质量管理文件，明确了各项质量活动的控制原则和控制方法。形成了由质量保证部、生产车间和生产线组成的三级质量管理网络，质量活动逐级负责。质量管理活动言有“据”、行有“轨”、查有“迹”，各级质量管理人员深入生产第一线，按照GMP要求和企业的质量管理规定对生产过程进行全方位监督检查，确保产品的质量。

质量控制部配备国内外先进的质量检验设备，如高效液相色谱仪、气相色谱仪、原子吸收分光光度计、红外分光光度计、紫外分光光度计等。通过现代化的检测手段，科学、细致地进行原辅料、包装材料、中间产品和成品的各项检验工作。在提高检验设施、完善硬件的同时，质量检验软件也在不断的充实和完善，通过软件的实施和运用，促进各项检验操作达到规范化、程序化，保证检验工作达到“规范、准确、及时”。